Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RAD51D-202ENST00000345365 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SMIM2-AS1-203ENST00000618753 2101 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PKD1L3-201ENST00000620267 5199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TRPM3-210ENST00000377111 4618 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC078846.1-201ENST00000608694 7083 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC016251.1-201ENST00000624299 4198 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MYH13-201ENST00000252172 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TNC-203ENST00000423613 6281 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 THADA-202ENST00000402360 2974 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SERPINB13-201ENST00000269489 3206 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RP1-201ENST00000220676 7100 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 KIAA0556-201ENST00000261588 6616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SYK-202ENST00000375747 4908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CDH11-202ENST00000394156 6874 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LINC01694-202ENST00000441095 6721 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ATP8B1-201ENST00000283684 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TARS-201ENST00000265112 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms