Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 VCAN-208ENST00000512590 5923 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 MEP1B-204ENST00000581447 2308 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.2 ms