Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LAMB3Q13751 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms