Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TSTA3Q13630 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TSTA3Q13630 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms