Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms