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| MTMR3 | Q13615 | UNC80-201 | ENST00000272845 | 13440 nt | TSL 5 BASIC | 8.02 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | CYBRD1-203 | ENST00000409484 | 1493 nt | TSL 2 BASIC | 8.02 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SF3A3P1-201 | ENST00000446317 | 1477 nt | BASIC | 8.02 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | BCL2L14-211 | ENST00000586576 | 1927 nt | TSL 5 BASIC | 8.02 | □□□□□ -1.13 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | DCX-203 | ENST00000371993 | 9231 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 8.02 | □□□□□ -1.13 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | AC018688.1-201 | ENST00000636528 | 1754 nt | BASIC | 8.02 | □□□□□ -1.13 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | AC067968.1-201 | ENST00000591793 | 3766 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ZNF385B-201 | ENST00000336917 | 2610 nt | TSL 5 BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC005614.1-201 | ENST00000598952 | 3653 nt | BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | NEXMIF-203 | ENST00000616200 | 10624 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | PJA2-201 | ENST00000361189 | 4889 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ARHGEF3-214 | ENST00000497267 | 2197 nt | TSL 2 BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | KAT6B-204 | ENST00000372724 | 7106 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC006042.3-201 | ENST00000454684 | 1469 nt | BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | OTX2-AS1-201 | ENST00000534909 | 2428 nt | TSL 1 (best) BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | CCNB3-204 | ENST00000376042 | 4693 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SCIN-209 | ENST00000519209 | 2660 nt | TSL 2 BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | TPD52-202 | ENST00000379097 | 2563 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SP140-205 | ENST00000420434 | 3169 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | TRIM6-202 | ENST00000380097 | 3403 nt | TSL 1 (best) BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ADAM7-204 | ENST00000520720 | 1870 nt | TSL 1 (best) BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | OR2B6-201 | ENST00000244623 | 942 nt | APPRIS P1 BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | DEFB4A-201 | ENST00000302247 | 380 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | CNIH4-201 | ENST00000366856 | 808 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | MIR551B-201 | ENST00000384984 | 96 nt | BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | CCL7-203 | ENST00000394630 | 687 nt | TSL 1 (best) BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |
| MTMR3 | Q13615 | CHMP1B2P-201 | ENST00000399581 | 597 nt | BASIC | 8.01 | □□□□□ -1.13 | | |