Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 SF3A3P1-201ENST00000446317 1477 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 PRLR-202ENST00000310101 1297 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 RN7SKP207-201ENST00000411204 303 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC092042.2-201ENST00000417304 331 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC231533.2-201ENST00000419045 978 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 GAPDHP73-201ENST00000423411 1007 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 KLF7-IT1-201ENST00000428777 655 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC016629.2-201ENST00000597341 199 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC233702.2-201ENST00000618784 583 ntTSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 OR13D1-202ENST00000641530 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 TPD52-202ENST00000379097 2563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms