Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms