Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL132671.1-201ENST00000415736 308 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL512413.1-201ENST00000606489 382 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms