Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PICALMQ13492 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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