Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 HNRNPH1P2-201ENST00000396845 1210 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.6 ms