Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 APOBEC4-201ENST00000308641 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 PTPRB-208ENST00000550358 6583 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ZBTB21-203ENST00000398499 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CLEC7A-208ENST00000525605 573 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MTND6P1-201ENST00000417434 424 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC119674.1-201ENST00000641611 1210 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SLC22A9-201ENST00000279178 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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