Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms