Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC103563.8-201ENST00000415716 318 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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HOXD11P31277 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 IGKV1-5-201ENST00000496168 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 IGHV1-67-201ENST00000519713 357 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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HOXD11P31277 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC010615.4-201ENST00000600810 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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HOXD11P31277 KRT80-201ENST00000313234 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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HOXD11P31277 CD44-205ENST00000352818 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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HOXD11P31277 AC046185.1-201ENST00000580553 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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HOXD11P31277 SMARCA2-258ENST00000637103 5657 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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HOXD11P31277 GUCY1A3-208ENST00000511507 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 TACC1-204ENST00000518415 3011 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MCTP1-204ENST00000505078 2629 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RBMY1F-202ENST00000454978 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 DLGAP1-AS2-201ENST00000572856 2261 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ADORA3-201ENST00000241356 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ZNF540-210ENST00000592533 3147 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SUMO2-202ENST00000420826 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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