Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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HOXD10P28358 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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HOXD10P28358 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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HOXD10P28358 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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HOXD10P28358 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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HOXD10P28358 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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HOXD10P28358 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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HOXD10P28358 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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HOXD10P28358 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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HOXD10P28358 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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HOXD10P28358 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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