Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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