Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 TATDN1-220ENST00000605953 726 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 Metazoa_SRP.124-201ENST00000610352 345 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MIR6762-201ENST00000613340 86 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 STX18-AS1-206ENST00000608184 3047 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SH3GLB1-205ENST00000616170 6456 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SELP-202ENST00000367786 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 FCGR3B-209ENST00000614870 1993 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 THAP12P6-201ENST00000431978 2310 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MAP9-201ENST00000311277 7333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC105760.1-201ENST00000244820 2231 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 HERC2P5-201ENST00000562687 3825 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL136146.1-201ENST00000529830 1667 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ODF2-209ENST00000434106 3890 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PHBP1-201ENST00000392260 808 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC245014.1-201ENST00000427732 381 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL136454.1-201ENST00000443181 466 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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TRIM35Q9UPQ4 AP003774.3-201ENST00000457725 985 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC013787.1-201ENST00000460165 307 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL508P-201ENST00000464472 303 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SSU72P8-201ENST00000473520 585 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC034232.2-201ENST00000511579 917 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL583859.2-202ENST00000602311 505 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 U1.22-201ENST00000605806 164 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CSTL1-205ENST00000619238 477 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MSH5-205ENST00000395853 2704 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 OR4K17-202ENST00000641386 4886 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 C1QTNF7-204ENST00000429690 4464 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MYH2-201ENST00000245503 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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TRIM35Q9UPQ4 SPRY1-202ENST00000394339 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 DNAH11-212ENST00000620169 13670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 C2CD3-202ENST00000334126 7960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ZNF791-201ENST00000343325 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SLC12A1-203ENST00000396577 4708 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 YES1-205ENST00000584307 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CLCN3P1-202ENST00000609203 1944 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 STAU2-226ENST00000524104 2173 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 THADA-202ENST00000402360 2974 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SNRK-AS1-201ENST00000422681 750 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC117395.3-201ENST00000471176 680 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC026254.1-201ENST00000479473 431 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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