Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms