Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.4 ms