Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms