Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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COL4A6Q14031 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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COL4A6Q14031 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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COL4A6Q14031 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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COL4A6Q14031 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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COL4A6Q14031 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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