Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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