Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AL450313.1-201ENST00000366376 452 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AC108120.1-201ENST00000506543 991 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 CLEC4E-206ENST00000545274 730 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AC092142.1-202ENST00000567021 829 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXE3Q13461 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXE3Q13461 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXE3Q13461 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
FOXE3Q13461 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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