Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 THAP12P6-201ENST00000431978 2310 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 DHX35-201ENST00000252011 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LNX1-201ENST00000263925 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC008537.3-201ENST00000623128 1881 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ZNF300P1-201ENST00000356555 1822 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ARMCX5-GPRASP2-206ENST00000476910 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 FAH-204ENST00000539156 3427 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC108451.1-201ENST00000558208 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 IKZF3-207ENST00000377944 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 IKZF3-208ENST00000377945 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 GIN1-201ENST00000399004 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 OR9I1-202ENST00000641439 3184 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ZNF611-206ENST00000595798 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CASK-204ENST00000378166 3123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC01347-202ENST00000627498 3841 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ATP5A1P3-201ENST00000573189 1507 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ADD2-204ENST00000407644 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MAGEE1-201ENST00000361470 3630 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 Z97200.1-201ENST00000606154 2045 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CDHR3-211ENST00000478080 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MAPK10-228ENST00000512689 2583 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MAMDC2-AS1-204ENST00000448377 1923 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MYL6-201ENST00000293422 664 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RPL5P35-201ENST00000398869 816 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL109918.1-202ENST00000406724 436 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RPS7-204ENST00000407445 833 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC000362.1-201ENST00000433725 425 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC239860.1-201ENST00000444680 1270 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC005840.2-201ENST00000447193 355 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 HSPD1P18-201ENST00000504252 244 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 GUSBP3-201ENST00000509348 423 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RAB30-205ENST00000527633 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 OR4A7P-201ENST00000531463 910 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC006065.2-201ENST00000536978 211 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC022239.4-201ENST00000602626 504 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 DNAI1-201ENST00000242317 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SLC11A2-203ENST00000394904 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 TTC6-203ENST00000476979 2253 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CFAP58-202ENST00000369704 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MAPK10-248ENST00000640490 2715 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SETD7-207ENST00000608958 5281 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC00210-201ENST00000431637 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 THBS3-201ENST00000368378 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms