Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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TRAF1Q13077 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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TRAF1Q13077 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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TRAF1Q13077 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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TRAF1Q13077 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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TRAF1Q13077 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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