Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXC13P31276 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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