Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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HOXD10P28358 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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HOXD10P28358 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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HOXD10P28358 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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HOXD10P28358 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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HOXD10P28358 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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HOXD10P28358 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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HOXD10P28358 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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HOXD10P28358 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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HOXD10P28358 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
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