Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SNX29P2-204ENST00000603801 875 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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