Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 HHLA3-203ENST00000370940 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 USP12-AS2-201ENST00000452222 279 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AP006437.1-202ENST00000530327 933 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 PRELID1P3-201ENST00000450055 643 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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