Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 RNASEH2B-AS1-209ENST00000631080 1707 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 DSG4-201ENST00000308128 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 CORO2A-201ENST00000343933 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 FKBP5-204ENST00000542713 7384 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 ASIC5-201ENST00000537611 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 BTN2A1-207ENST00000541522 2845 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 ZNF300-205ENST00000446148 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 AC093392.1-201ENST00000366280 340 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 MORF4L1P1-201ENST00000404582 967 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 AL513302.1-201ENST00000415679 428 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 LINC00385-201ENST00000435044 374 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 NEFLP1-201ENST00000436364 984 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 AL445686.1-201ENST00000443086 348 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 RNU7-179P-201ENST00000516608 68 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 FXYD5-207ENST00000541435 898 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 AC125421.2-202ENST00000580776 477 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 HIGD1B-205ENST00000591513 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 MSL3-202ENST00000337339 3446 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 ADGRG1-267ENST00000568909 4254 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 ZNF45-201ENST00000269973 3898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 MAPT-AS1-204ENST00000634876 3602 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 MTO1-201ENST00000370300 2961 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 ZNF547-201ENST00000282282 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 DOK6-201ENST00000382713 8890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 RFX4-202ENST00000357881 2565 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 NEK6-215ENST00000546191 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 DHX40-201ENST00000251241 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LHX8Q68G74 FGFR2-209ENST00000369056 2650 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 MLLT3-209ENST00000629733 3264 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 KCNA2-215ENST00000640956 1584 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 ACAN-206ENST00000559004 7628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 ZNF423-202ENST00000535559 4201 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 GJB2-202ENST00000382848 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 NUSAP1-212ENST00000560747 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 IKZF3-208ENST00000377945 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 HPCAL4-202ENST00000612703 4436 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 AL356235.1-201ENST00000602791 2363 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 SPTBN5-201ENST00000320955 11725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 PSG5-205ENST00000404580 2145 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 NMNAT1-201ENST00000377205 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 GGA3-202ENST00000538886 3766 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 IBSP-201ENST00000226284 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 BIVM-ERCC5-201ENST00000602836 5143 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 GAS7-201ENST00000323816 8033 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 GAS7-204ENST00000437099 8003 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 GPR158-201ENST00000376351 6959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 DTNA-209ENST00000556414 1626 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 ACOT11-202ENST00000371316 6369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 AL138807.1-201ENST00000400354 459 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 AL390856.1-201ENST00000412174 628 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 AC004830.1-201ENST00000420449 285 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 LINC02428-203ENST00000513793 438 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 GZMB-205ENST00000526004 819 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LHX8Q68G74 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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