Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 OR5M4P-201ENST00000529436 925 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 THSD4-AS1-204ENST00000566268 468 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms