Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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ITGA9Q13797 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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ITGA9Q13797 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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ITGA9Q13797 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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ITGA9Q13797 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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ITGA9Q13797 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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ITGA9Q13797 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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ITGA9Q13797 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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ITGA9Q13797 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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ITGA9Q13797 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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