Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ALCAMQ13740 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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