Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms