Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC092435.1-202ENST00000512752 518 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR6M3P-201ENST00000531567 700 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AP001120.4-201ENST00000590231 108 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 BX005195.1-201ENST00000618097 1198 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PPP1R17-202ENST00000409146 569 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC017104.2-201ENST00000417000 321 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL161646.1-201ENST00000447860 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MIR4500HG-204ENST00000453832 827 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC083843.1-201ENST00000521444 849 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AP000893.2-201ENST00000527550 433 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC126755.2-209ENST00000531453 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PSMC1P8-201ENST00000536820 1296 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC138969.1-212ENST00000541593 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms