Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms