Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 ZRANB2-AS1-202ENST00000450461 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 LINC01234-202ENST00000547963 2088 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 PPFIA2-220ENST00000550584 5405 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 LRRC4C-202ENST00000527150 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 YES1-205ENST00000584307 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 AL353807.3-201ENST00000500626 2505 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TM4SF4P48230 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms