Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms