Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms