Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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