Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC007106.1-201ENST00000509666 600 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms