Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 LPAR6-202ENST00000378434 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 ABCF2P1-201ENST00000465687 1867 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 MAP9-201ENST00000311277 7333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 IKZF5-201ENST00000368886 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 MYH2-204ENST00000532183 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 LINC02009-201ENST00000635852 2951 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 LL22NC03-63E9.3-201ENST00000407120 3111 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 EIF4E2-202ENST00000409098 3448 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 ARMC8-210ENST00000469044 4790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 STAT2-202ENST00000418572 1548 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 PARP9-202ENST00000462315 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 SLFN12L-202ENST00000361112 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 C7orf73-202ENST00000507606 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC008498.2-201ENST00000624033 2322 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 BCRP8-201ENST00000412037 255 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL031584.2-201ENST00000420585 767 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AAMDC-203ENST00000525034 511 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 LINC00964-204ENST00000528090 572 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 SERPINA15P-201ENST00000529287 266 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 OR4C7P-201ENST00000533375 919 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC005262.1-201ENST00000588562 362 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 CFAP61-210ENST00000451767 1946 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 EPHB2-201ENST00000374627 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 OR2A4-201ENST00000315453 1758 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 TROVE2-201ENST00000367441 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 OR6N1-203ENST00000641846 2640 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 ZNF343-208ENST00000617391 3300 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL109811.1-201ENST00000452378 2682 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 LINC00501-201ENST00000425388 2046 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 BCL6-201ENST00000232014 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 MASP1-205ENST00000392472 3900 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 TTC26-202ENST00000430935 4198 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms