Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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USP18Q9UMW8 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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USP18Q9UMW8 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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USP18Q9UMW8 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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USP18Q9UMW8 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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USP18Q9UMW8 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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USP18Q9UMW8 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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USP18Q9UMW8 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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USP18Q9UMW8 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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USP18Q9UMW8 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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USP18Q9UMW8 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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