Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms