Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 HBBP1-201ENST00000433329 439 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 FDPSP8-201ENST00000438304 1089 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 DACT3-AS1-202ENST00000525008 496 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OR7E1P-201ENST00000533891 958 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC068790.1-201ENST00000536166 355 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RD3L-201ENST00000557640 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OR4F28P-201ENST00000559128 938 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OR4F8P-201ENST00000589943 937 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RGS2-201ENST00000235382 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 TAS2R2P-201ENST00000421146 910 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RPSAP62-201ENST00000432596 833 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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