Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 LHFPL3-AS2-202ENST00000631061 1832 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF347-207ENST00000601469 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ICK-201ENST00000350082 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 FER-209ENST00000618353 1420 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 HHLA2-205ENST00000467562 1457 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC103760.1-201ENST00000521326 1486 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC019117.2-202ENST00000635900 1476 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PSG9-209ENST00000621109 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RIPOR2-206ENST00000538035 5389 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms