Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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CCDC96Q2M329 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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CCDC96Q2M329 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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CCDC96Q2M329 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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CCDC96Q2M329 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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CCDC96Q2M329 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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CCDC96Q2M329 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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CCDC96Q2M329 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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CCDC96Q2M329 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC96Q2M329 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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