Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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NRF1Q16656 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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NRF1Q16656 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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