Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 OPRM1-205ENST00000414028 2485 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC02159-202ENST00000518580 2323 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL353052.2-201ENST00000441459 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 VAMP3-201ENST00000054666 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LRRC31-204ENST00000523069 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC073349.2-201ENST00000427545 1603 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MAPK10-329ENST00000641555 2656 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC124045.1-201ENST00000606008 1953 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LDAH-208ENST00000435420 3837 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SS18L2P1-201ENST00000445923 213 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC01974-201ENST00000575126 494 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC010323.2-201ENST00000596405 594 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 FLG-AS1-202ENST00000392688 2995 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ACTR6-209ENST00000551617 1715 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 GOSR2-238ENST00000640495 3395 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms