Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 RN7SL619P-201ENST00000581753 258 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AC010761.2-202ENST00000582536 391 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 7SK.12-201ENST00000612820 244 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 RHOXF1P2-201ENST00000635431 502 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 LINC00598-212ENST00000637124 905 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 RAB13-205ENST00000614713 1353 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AFF1-211ENST00000544085 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 CPB2-AS1-204ENST00000606991 3218 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 ELAVL2-203ENST00000380117 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 KAT14-206ENST00000489634 3152 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 LDAH-201ENST00000237822 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 PPIA-204ENST00000468812 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 LINC00955-202ENST00000514422 1502 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 GLYAT-202ENST00000344743 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 C4BPB-201ENST00000243611 1117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 VNN3-201ENST00000275223 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 WFDC8-201ENST00000289953 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 OR2G2-201ENST00000320065 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 RNA5SP263-201ENST00000363376 128 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 LY6G6D-223ENST00000375825 402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 MED15P8-201ENST00000411601 545 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 ENTPD3-AS1-201ENST00000420850 791 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AC008496.2-201ENST00000421252 460 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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TLR1Q15399 ECHDC1-207ENST00000430841 1009 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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TLR1Q15399 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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TLR1Q15399 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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TLR1Q15399 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 CSF2RA-217ENST00000494969 489 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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TLR1Q15399 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AP000435.1-201ENST00000528539 496 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 STXBP6-204ENST00000546511 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 OTX2-204ENST00000554788 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AC022558.2-201ENST00000566841 754 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 EIF4A1P9-201ENST00000576035 1207 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AC087499.3-201ENST00000578210 717 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 APOC2-202ENST00000585786 880 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 APOC2-204ENST00000591597 447 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AC016405.2-201ENST00000607393 312 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TLR1Q15399 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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