Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
NBR1Q14596 FGG-203ENST00000404648 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NBR1Q14596 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NBR1Q14596 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
NBR1Q14596 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
NBR1Q14596 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 TCL6-207ENST00000483087 2194 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 RIPOR2-205ENST00000510784 3381 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 CDY2B-201ENST00000382867 1961 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 RBP2-201ENST00000232217 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 CENPW-201ENST00000368325 528 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 MAS1L-201ENST00000377127 1260 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AP000350.3-201ENST00000440099 289 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 FTH1P27-201ENST00000449509 551 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 LINC02530-201ENST00000457945 894 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 ABCA9-AS1-201ENST00000458677 523 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 RPL5P29-201ENST00000482972 894 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AC112192.1-201ENST00000515086 553 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 SLA-223ENST00000524345 1003 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AP003532.1-201ENST00000529936 310 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 DRAIC-204ENST00000558781 1222 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 DYM-207ENST00000578396 755 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 HMGN2P46-208ENST00000598619 490 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AC025031.3-201ENST00000611566 368 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 CU639417.5-201ENST00000623983 476 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AC084879.1-201ENST00000636165 1201 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AC012360.3-201ENST00000610036 3449 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AC133552.3-201ENST00000572236 1869 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 IKZF3-214ENST00000467757 1362 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 CD44-205ENST00000352818 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 KRTAP9-9-201ENST00000394008 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 KRTAP9-1-201ENST00000398470 753 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 SNRPGP11-201ENST00000411777 232 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NBR1Q14596 AC106017.1-202ENST00000424109 428 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms